ciao, come prima cosa ti chiedo: hai valutato bene l'utilizzo della fault tolerance? giusto per accademia ricordiamoci che FT usa molta banda quindi è bene predisporre la rete, per es con una vlan separata e anche dedicando una nic solo a lei (tipicamente usando il gioco degli adattatori attivi/stanby).
Inoltre consuma il doppio di risorse (ram, cpu, storage) e impone forti limiti (max 1vCPU e no snapshot).
Detto questo, premesso che bisognerebbe sempre avere dei backup delle VM (a prescindere che si facciano aggiornamenti o meno...), non starei a pormi tutti quei problemi: con vMotion liberi un nodo del cluster e lo aggiorni, e via con gli altri 3.
Ricorda anche che prima di tutto devi aggiornare il/i vCenter (che io farei virtuali). Poi non ho ben capito la questione licenze: se hai una licenza vCenter standard te ne basta uno...